Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rdh16O54909 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rdh16O54909 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rdh16O54909 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16O54909 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16O54909 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh16O54909 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16O54909 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rdh16O54909 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16O54909 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16O54909 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh16O54909 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rdh16O54909 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16O54909 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rdh16O54909 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdh16O54909 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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