Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DffaO54786 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DffaO54786 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DffaO54786 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DffaO54786 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DffaO54786 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DffaO54786 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DffaO54786 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DffaO54786 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
DffaO54786 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DffaO54786 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DffaO54786 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DffaO54786 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DffaO54786 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DffaO54786 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DffaO54786 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DffaO54786 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DffaO54786 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DffaO54786 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DffaO54786 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DffaO54786 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DffaO54786 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DffaO54786 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DffaO54786 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DffaO54786 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DffaO54786 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DffaO54786 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DffaO54786 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DffaO54786 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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