Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnnd2O35927 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnd2O35927 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms