Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emp3O35912 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emp3O35912 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emp3O35912 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms