Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl25O35903 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl25O35903 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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