Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Timm44O35857 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Timm44O35857 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Timm44O35857 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Timm44O35857 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Timm44O35857 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timm44O35857 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timm44O35857 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timm44O35857 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timm44O35857 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Timm44O35857 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Timm44O35857 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Timm44O35857 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms