Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag2O35638 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag2O35638 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag2O35638 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stag2O35638 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag2O35638 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stag2O35638 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stag2O35638 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag2O35638 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms