Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Opn1mwO35599 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn1mwO35599 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.9 ms