Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt1O35449 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt1O35449 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms