Protein–RNA interactions for Protein: O35386

Phyh, Phytanoyl-CoA dioxygenase, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhyhO35386 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PhyhO35386 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PhyhO35386 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PhyhO35386 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms