Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppef2O35385 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppef2O35385 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppef2O35385 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms