Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kpna3O35344 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Kpna3O35344 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms