Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pkd2O35245 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pkd2O35245 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkd2O35245 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms