Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArxO35085 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArxO35085 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArxO35085 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArxO35085 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArxO35085 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArxO35085 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArxO35085 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArxO35085 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArxO35085 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArxO35085 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArxO35085 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ArxO35085 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArxO35085 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArxO35085 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ArxO35085 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArxO35085 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArxO35085 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArxO35085 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ArxO35085 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArxO35085 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArxO35085 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArxO35085 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArxO35085 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArxO35085 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArxO35085 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArxO35085 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArxO35085 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArxO35085 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArxO35085 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ArxO35085 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ArxO35085 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ArxO35085 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ArxO35085 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ArxO35085 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ArxO35085 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArxO35085 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArxO35085 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArxO35085 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArxO35085 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArxO35085 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ArxO35085 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArxO35085 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArxO35085 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArxO35085 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ArxO35085 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArxO35085 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArxO35085 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArxO35085 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArxO35085 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArxO35085 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ArxO35085 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArxO35085 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArxO35085 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArxO35085 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArxO35085 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ArxO35085 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ArxO35085 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArxO35085 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArxO35085 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArxO35085 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ArxO35085 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms