Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Eftud2O08810 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Eftud2O08810 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms