Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6871L7N248 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6871L7N248 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms