Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3685J3QPP2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3685J3QPP2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms