Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9602J3QPD5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms