Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gm19965J3QNY8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gm19965J3QNY8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gm19965J3QNY8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Gm19965J3QNY8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Gm19965J3QNY8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm19965J3QNY8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Gm19965J3QNY8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Gm19965J3QNY8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Gm19965J3QNY8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm19965J3QNY8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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