Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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