Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ccdc180J3QNE4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc180J3QNE4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Ccdc180J3QNE4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms