Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21972J3QN38 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms