Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E030018B13RikJ3QMS9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E030018B13RikJ3QMS9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms