Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700014D04RikJ3QMS2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700014D04RikJ3QMS2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms