Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930544D05RikJ3QK56 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930544D05RikJ3QK56 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930544D05RikJ3QK56 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms