Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
7530416G11RikJ3QJX6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms