Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21818J3KMS6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21818J3KMS6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms