Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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