Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20830J3KML6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20830J3KML6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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