Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pot1bH7BX60 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pot1bH7BX60 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms