Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17lcG5E8I7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lcG5E8I7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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