Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r34G3XA52 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms