Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zkscan2G3X952 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zkscan2G3X952 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms