Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Srp72F8VQC1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp72F8VQC1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms