Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc37F8VPK0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc37F8VPK0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc37F8VPK0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc37F8VPK0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms