Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M1F7CXU4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms