Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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Gm5861F6VCN9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5861F6VCN9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Gm5861F6VCN9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Gm5861F6VCN9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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Gm5861F6VCN9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Gm5861F6VCN9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Gm5861F6VCN9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5861F6VCN9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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