Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pagr1bF6V0H0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pagr1bF6V0H0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pagr1bF6V0H0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms