Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm340F6RGI3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm340F6RGI3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms