Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Erich3F6QRE9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Erich3F6QRE9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Erich3F6QRE9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Erich3F6QRE9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Erich3F6QRE9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Erich3F6QRE9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Erich3F6QRE9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Erich3F6QRE9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Erich3F6QRE9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Erich3F6QRE9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Erich3F6QRE9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Erich3F6QRE9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms