Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm29094F6Q785 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm29094F6Q785 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms