Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf4E9QAP7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf4E9QAP7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms