Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzd7E9Q9W7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd7E9Q9W7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd7E9Q9W7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms