Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp17lbE9Q9U0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp17lbE9Q9U0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp17lbE9Q9U0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
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