Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc146E9Q9F7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc146E9Q9F7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc146E9Q9F7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms