Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc141E9Q8Q6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc141E9Q8Q6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms