Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5407E9Q7Q1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5407E9Q7Q1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms