Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdhr2E9Q7P9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdhr2E9Q7P9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms