Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FancfE9Q5Z5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FancfE9Q5Z5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms