Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms