Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb9E9Q5G2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms